Updates and Results Talks and Posters Advice Ideas Important Figures Write-Ups Outreach How-To Funding Opportunities GENETIS
  GENETIS, Page 2 of 13  ELOG logo
New entries since:Wed Dec 31 19:00:00 1969
Entry  Fri Apr 3 05:24:59 2026, Alex M, GENETIS Hackathon Summary and Next Steps 
This entry will serve to summarize what tasks we've completed and still need to complete after last week's GENETIS hackathon.

Alex

My focus was on the XF scripting for making the PUEO antenna. Before last week, we had a script which made the geometry of a PUEO-like antenna.
Entry  Wed Apr 1 02:33:44 2026, Jacob Weiler, pueoSim Input Files 
Input File Format for pueoSim (Also ICEMC)

Frequency Range: From 200 MHz to 1500 MHz incrementing by 10 MHz steps

 

There are 8 different files that are required for pueoSim. They are:
Entry  Sun Mar 29 08:55:02 2026, Dylan Wells, Guide to Updating pueoSim  
How To Update PueoSim For GENETIS:

 

First, whoever updates pueoSim needs access to pueoBuilder, pueoSim, and niceMC on GitHub (ask Will for permissions).
Entry  Wed Aug 2 00:17:32 2023, Jacob Weiler, XF Antenna Drawing Progress 08/02/2023 sidepic.PNGcircuitboardplacement.PNGfullpic.PNGstruts.PNG
I've been building in XF and have ran into some issues but currently have the following completed:

- Struts are placed, though they are not evenly spaced and the same. I have contacted XF to try and figure out how to get rotation/patterns to
do what we need
Entry  Tue Mar 17 16:18:29 2020, Julie Rolla, GENETIS Planning Meeting  
Attendance: Julie Rolla, Alex M. 

Today Alex and I met to discuss how to move forward given the COVID-19 restrictions. We have resent out a message polling people's schedules
to create online working sessions. Here is what we are planning:
Entry  Thu Mar 26 02:18:17 2026, Ryan Debolt, Multigenerational Narrative draft 2 
This is a multigenerational tracing of our second-best individual's parents and children:

The second-best individual in this evolution was
Bicone 22 from generation 40. This individual is, in fact, a fascinating case as we shall see. But to start the story of this individual we will go back
Entry  Tue Aug 9 15:28:50 2022, Ryan Debolt, How many individuals to use in the GA. 
One of our foundational questions tied to the optimization of the GA has been "How many individuals should we simulate". Up to now, our minds
were made up for us by the speed of arasim being great enough that the time cost of simulating individuals was great enough that the improvements made
from having more were not enough to justify the slowdown. However, with the upgrade to the faster, more recent version of arasim, I decided to re-examine
Entry  Wed Mar 25 02:48:02 2026, Alex Patton, GENETIS Daily Updates 
Today's Summer 2020 daily update:

As a note, today OSC was down so productivity was more limited




Name
Update for Today
Plans for Tomorrow


Alex
M.

Mostly just wrote more on the paper in the Genetic Algorithm section. I added some citation that we used in ICRC but there are
Entry  Wed Mar 25 00:11:25 2026, Alex M, Daily Update 7/24/20 



Name
Update
Plans for Monday


Alex
M
 
 


Alex P
 
 


Eliot
 
 


Leo
 
 


Ryan
 
 


Evelyn
 
 


Ben
 
 


Ethan
 
 




 
Entry  Mon Jun 2 14:10:59 2025, Jacob Weiler, Building Status 06/02/2025 Building_Dump_of_Useful_Materials.txtSimulating_Building_Model.txtBuilding_Dump.txtdone_with_change_materials.zip
We are almost to where we can start the physical building of the antenna! 

I've attached all the information I currently have regarding the building project. Some of it is messy work notes and some is well-structured.

I’ve attached the following files for the GENETIS building project:
Entry  Sun Oct 20 13:11:09 2024, Dylan Wells, OSU Physics Scholarship Opportunities 
Here are some scholarships available to physics majors I've been lucky enough to receive throughout undergrad that allowed me to work on this project
unpaid without needing supplemental income from a separate job or loans. 

1. OSU
Entry  Tue May 21 09:55:57 2024, Jacob Weiler, AraSim CSE Spring 2024 Work 
# AraSim CSE Spring 2024 Work

## Goals 
The main goal was to get a working multithreaded version of the AraSim codebase working. Doing this, the hope was to learn how to multithread the
Entry  Mon Aug 21 15:47:13 2023, Amy, OSC license agreement to be able to use XF User_Software_Agreement-1.pdfxfdtd.pdf
Attached is the license agreement that each person should sign to be able to use XF on OSC.  You can sign it, send it to Amy, and she will return
it to OSC with her signature on it.
Entry  Wed Aug 2 12:49:57 2023, Dylan Wells, Line of Best-Fit Straightened Sides Antenna output.pngimage_(3).pngoutput.png
Previously, we have tried to straighten the sides of the best-evolved curved antenna in elog
229. However, there were potential issues with how closely this line resembled the curve of the antenna.

So, I attempted to create another straightened sides antenna using a linear regression model to find the best fitting line for the curve to create
Entry  Tue Jul 25 16:07:25 2023, Dylan Wells, Parallelizing XF and pueoSim in the loop 
Standard Loop Architecture:

Complete an evolutionary step FOR EACH antenna before continuing on with the next step.

Steps:
Entry  Mon Jul 24 15:51:28 2023, Ryan Debolt, Test Loop runs that need done. 


Types of runs I need (May need
some other people to help me run these):
Entry  Tue Jul 18 22:04:22 2023, Dylan Wells, Parallelizing pueoSim jobs 
Currently, the PUEO loop runs pueoSim with 1 pueoSim process per job submitted.

Each of these jobs has 1 node and 8 cores, however, pueoSim only needs a single core to run.

Here is some data I collected by running the same seed of pueoSim with different numbers of cores in the job:
Entry  Wed Jul 12 21:30:56 2023, Alex Machtay, Zoom training on XF 07/12/23 
Recording of training on XFdtd by Alex Machtay on July 12, 2023.

Entry  Thu Jul 6 14:52:09 2023, Jack Tillman, Building - Matching Circuit Schematic, PCB, and components Matching_Circuit_Schematic.pngMatching_Circuit_PCB.pngMatching_Circuit_DigiKey_Cart.pdfMatching_Circuit_DigiKey_Cart.csv
Attached are images of the matching circuit schematic and PCB design. A parts list is also attached in .pdf and .csv format. The .csv format can be imported
into Digikey if necessary.  

Table of component values:
Entry  Thu Jul 6 13:12:04 2023, Jack Tillman, Straightened Sides AraSim Results  Straightened_Sides_AraSim_Results.pdfStraightened_Sides_AraSim_Results.pptx
After discretizing and straightening the sides of the curved antenna that performed the best (Generation 13, individual 84) and running the antenna through
AraSim, the following results and physics plots were generated. 
ELOG V3.1.5-fc6679b