Updates and Results Talks and Posters Advice Ideas Important Figures Write-Ups Outreach How-To Funding Opportunities GENETIS
  GENETIS, Page 2 of 14  ELOG logo
Entry  Wed Nov 20 00:40:49 2019, Julie Rolla, Week 11/19/19 Update 
Attendance for today's session: Cade, Julie, Alex M, Mitchell, Scott. 

 

Tasks/to-do list:
Entry  Fri Nov 15 09:59:27 2019, Julie Rolla, Week 11/15/19 Update 
Attendance for today's session: Cade, Julie, Alex M, Mitchell, Scott. 

 

Tasks worked on:
Entry  Tue Nov 12 15:45:33 2019, Julie Rolla, Week 11/12/19 Update  GENETIS_meeting_minutes_11_|_7.pdf
Attendance for today's session: Cade, Julie, Alex M, Alex P, Mitchell, Scott. 

Monday was a holiday, and we will be replaceing that meeting later this week. Today we worked on the following tasks:

Tasks:
    Reply  Sun Apr 19 15:27:42 2026, Julie Rolla, Week 11/12/19 Update  
 




Quote:



Attendance for today's session: Cade, Julie, Alex M, Alex P, Mitchell, Scott. 
Entry  Wed Jul 14 15:45:30 2021, Ethan Fahimi, Wednesday Updates (7/14/2021) 



Ethan
Worked with Alex on fixing a few bugs with AREA. We are
trying to solve an issue where the individuals are not finishing runs (around one in every four gens with 100 individuals). We believe some individuals
may be too good and are then taking more than the wall time we have given them. Alex is testing this while I am working on a script that will add all the
Entry  Fri Feb 22 17:09:28 2019, Suren Gourapura, Updates that need to be added to the manual 
We are redesigning the way we simulate antennas in our loop. To do this, we changed our simulationPEC macro skeletons and our output skeleton. 

To make this easier, we changed the way we name the files, from i.uan where i is the simulation number, to i_j.uan where i is the antenna and
j is the frequency.
Entry  Thu Dec 5 16:58:55 2019, Julie Rolla, Updated To-Do List: Screen_Shot_2019-12-06_at_9.42.59_PM.pngScreen_Shot_2019-12-06_at_10.04.21_PM.pngProposal_To-Do_List.pdf
Updated To-Do List:


Add ARA constants in plotting code: ie
add Veff, theta, R for ARA. This will sit as a constant line for us to compare each evolving parameter to. For example, in the plot Veff vs Generation,
Entry  Fri Feb 22 15:46:33 2019, Julie Rolla, Updated To-Do List 
We are getting to the stage where we would like to verify each step. It has been requested by Amy that we verify them visually. Here are the plots we
need to make. 


Add plotting for L & R parameters (note that we already have similar software to this from the dipole check. You can find this in
Entry  Fri Aug 5 09:59:07 2022, Dennis Calderon, Updated Effective Volumes and Errors (Paper Run and Curved Sides) Effective_Volumes_Errors_2.pdffull_resimulate_DNA.csvoriginal_best_curved.pngbest_curved_quad_zero.pngbest_curved_same_radii.png
Update to previous ELOG post for Effective Volumes and Errors for AraSim simulations for antennas from Paper_Run and Curved_Sides.

AraSim version compiled ~11/2021 and the (old) GENETIS version

 
Entry  Mon Oct 5 17:34:32 2020, Leo Deer, Update Monday 10/5/2020 FixedFScore.pngRedPlot.png



Name
Update
Plans for Monday


Alex
M

 

 


Alex P
 
Finish up mutation function and then make sure it functions
Entry  Fri Oct 2 17:11:25 2020, Ethan Fahimi, Update Friday 10/2/2020 Screen_Shot_2020-10-02_at_5.39.33_PM.png



Name
Update
Plans for Monday


Alex
M

 

 


Alex P
 
 


Eliot
 
 


Leo
Today
Entry  Wed Sep 9 17:28:54 2020, Alex M, Update 9/9/20 



Name
Update
Plans for tomorrow


Alex
M

I've been working on readying the loop for the transition to slurm. OSC is switching from its current job managing software
(torque/moab) to slurm, which uses some different commands but is functionally similar. Since we have places where jobs are called in the script, I've
Entry  Tue Jan 26 17:17:41 2021, Ethan Fahimi, Tuesday Updates 01/26/2021 



Ethan F
Continued implementing some solutions the OSC helpdesk
gave me for fixing the unwanted extensions on the job output files.


 
 


 
 


 
 


 
 


 
 


 
 


Entry  Mon May 22 20:34:59 2023, Amy, Things to do before starting new PUEO run from 5/22/23 meeting 
Here is a list of things we agreed to do before starting a new PUEO run.  Feel free to add notes here as things are done and we will revisit the
list next week.

Change range of the height variable to 0.75-1.75m
Entry  Mon Jul 24 15:51:28 2023, Ryan Debolt, Test Loop runs that need done. 


Types of runs I need (May need
some other people to help me run these):
Entry  Mon Oct 7 15:35:01 2024, Dylan Wells, Template Run Results Slide Deck 
Copy this slide deck to use when presenting on run updates!

https://docs.google.com/presentation/d/1Tk-B1QbFTP_5pQZovfn0_wbTswZTmOrJURpi374xJWo/edit?usp=sharing
    Reply  Sat Apr 18 02:21:30 2026, Dylan Wells, Template Run Results Slide Deck 
 




Quote:



Copy this slide deck to use when presenting on run updates!
Entry  Wed Nov 20 15:05:14 2019, Julie Rolla, Task update 11/20/19 
​Today I spent some time looking at task 1 from the update here: http://radiorm.physics.ohio-state.edu/elog/GENETIS/20.
Below are my updates. 

 
Entry  Mon Jun 24 13:49:49 2019, Julie Rolla, Summer update 
Right now the following people are working on this project:

Julie Rolla, Cade Sbrocco, Scott Janse, Alex Patton, Eliot Ferstl, Abassi Brown, Evelyn Shank, Sophie Dunlap

Today we met for our first working meeting. Scott, Alex, and Eliot were asked to speed up and optimize AraSim. Sophie and Evelyn are working
Entry  Thu Jul 6 13:12:04 2023, Jack Tillman, Straightened Sides AraSim Results  Straightened_Sides_AraSim_Results.pdfStraightened_Sides_AraSim_Results.pptx
After discretizing and straightening the sides of the curved antenna that performed the best (Generation 13, individual 84) and running the antenna through
AraSim, the following results and physics plots were generated. 
ELOG V3.1.5-fc6679b