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Entry  Tue Nov 27 09:43:37 2018, Brian Clark, Plot Two TH2Ds with Different Color Palettes, Analysis demo.ccMakefiletest.png
Say you want to plot two TH2Ds with on the same pad but different color paletettes?

This is possible, but requires a touch of fancy ROOT-ing. Actually, it's not that much, it just takes a lot of time to figure it out. So
here it is.
Entry  Fri Nov 9 00:44:09 2018, Brian Clark, Transfer files from IceCube Data Warehouse to OSC,  
Brian had to move ~7 TB of data from the IceCube data warehouse to OSC.

To do this, he used the gridftp software. The advantage is that griftp is optimized for large file transfers, and will manage data transfer better
than something like scp or rsync.
Entry  Fri Oct 26 18:08:43 2018, Jorge Torres, Analyzing effective volumes, Analysis veff.shveff_aeff2.Cveff_aeff2.mkmake_plot.py
Attaching some scripts that help processing the effective volumes. This is an extension of what Brian Clark did in a previous post (http://radiorm.physics.ohio-state.edu/elog/How-To/27)

There are 4 files attached:

- veff_aeff2.C and veff_aeff2.mk. veff_aeff2.C produces Veff_des$1.txt ($1 can be A or B or C). This file contains the following
Entry  Mon Oct 1 19:06:59 2018, Brian Clark, Code to Compute Effective Volumes in AraSim, Analysis veff.ccveff.mk
Here is some C++ code and an associated makefile to find effective volumes from AraSim output files.

It computes error bars on the effective volumes using the relevant AraSim function.

Compile like "make -f veff.mk"
Entry  Sun Aug 26 19:23:57 2018, Brian Clark, Get a quick start with AraSim on OSC Oakley, Software forRishabh.tar.gz
These are instructions I wrote for Rishabh Khandelwal to facilitate a "fast" start on Oakley at OSC. It was to help him run AraSim in batch
jobs on Oakley.

It basically has you use software dependencies that I pre-installed on my OSC account at /users/PAS0654/osu0673/PhasedArraySimulation.
Entry  Wed Aug 1 11:37:10 2018, Andres Medina, Flux Ordering, Hardware 
Bought 951 Non-Resin Soldering Flux. This is the preferred variety. This could be found on this website https://www.kester.com/products/product/951-soldering-flux. 

The amount of Flux that was bought was 1 Gallon (Lasts quite some time). The price was $83.86 with approximate shipping of $43. This was done
Entry  Wed Jun 6 17:48:47 2018, Jorge Torres, How to build ROOT 6 on an OSC cluster,  
Disclaimer: I wrote this for Owens, which I think will also work on Pitzer. I recommend following Steven's instructions, and use mine if it fails
to build. J

1. Submit a batch job so the processing resources are not limited (change the project ID if needed.):
Entry  Wed Jun 6 08:54:44 2018, Brian Clark and Oindree Banerjee, How to Access Jacob's ROOT6 on Oakley,  env.sh
Source the attached env.sh file. Good to go!
Entry  Sun Apr 29 21:44:15 2018, Brian Clark, Access Deep ARA Station Data, Analysis plot_deep_station_event.cxx
Quick C++ program for pulling waveforms out of deep ARA station data. If you are using AraRoot, you would put this inside your "analysis" directory
and add it to your CMakeLists.txt.
Entry  Fri Mar 30 12:06:11 2018, Brian Clark, Get icemc running on Kingbee and Unity, Software 
So, icemc has some needs (like Mathmore) and preferably root 6 that aren't installed on kingbeen and unity.

Here's what I did to get icecmc running on kingbee.

Throughout, $HOME=/home/clark.2668
Entry  Tue Mar 20 09:24:37 2018, Brian Clark, Get Started with Making Plots for IceMC, Software 
First, anyone not familiar with the command line should familiarize yourself with
it. It is the way we interact with computers through an interface called the terminal: https://www.codecademy.com/learn/learn-the-command-line

 

Entry  Mon Mar 19 12:27:59 2018, Brian Clark, How To Do an ARA Monitoring Report, Other 
So, ARA has five stations down in the ice that are taking data. Weekly, a member of the collaboration checks on the detectors to make sure that they
are healthy.

This means things like making sure they are triggering at approximately the right rates, are taking cal pulsers, that the box isn't too hot,
Entry  Tue Dec 12 17:38:36 2017, Brian Clark, Data Analysis in R from day w/ Brian Connolly, Analysis pca_and_lda.Rdata.zip
On Nov 28 2017, Brian Connolly came and visited and taught us how to do basic data analysis in R.

He in particular showed us how to do a Linear Discriminant Analysis (LDA) and Principal Component Analysis (PCA).

Attached are three of the data files Carl Pfendner prepared for us to analyze (ARA data, including simulation, force triggers, and RF triggers).
Entry  Mon Nov 20 08:31:48 2017, Brian Clark and Oindree Banerjee, Fit a Function in ROOT, Analysis fitSnr.Chstripe1snr.rootstripe1snrfit.png
Sometimes you need to fit a function to a histogram in ROOT. Attached is code for how to do that in the simple case of a power law fit.

To run the example, you should type "root fitSnr.C" in the command line. The code will access the source histogram (hstrip1nsr.root,
which is actually ANITA-2 satellite data). The result is stripe1snrfit.png.
Entry  Thu Oct 26 08:44:58 2017, Brian Clark, Find Other Users on OSC, Other 
Okay, so our group has two "project" spaces on OSC (the Ohio Supercomputer). The first is for Amy's group, and is a project workspace called
"PAS0654". The second is the CCAPP Condo (literally, CCAPP has some pre-specified rental time, and hence "condo") on OSC, and this
is project PCON0003.
Entry  Thu Sep 21 14:30:18 2017, Julie Rolla, Using/Running XF,  
Below I've attached a video with some information regarding running XF. Before you start, here's some important information you need to know. 

 

In order to run XF:
Entry  Mon Sep 18 12:06:01 2017, Oindree Banerjee, How to get anitaBuildTool and icemc set up and working, Software 
First try reading and following the instructions here

https://u.osu.edu/icemc/new-members-readme/

Then e-mail me at oindreeb@gmail.com with your problems 
Entry  Sun Sep 17 20:05:29 2017, Spoorthi Nagasamudram, Some basic ,  
 
Entry  Fri Aug 25 12:34:47 2017, Amy Connolly - posting stuff from Todd Thompson, How to run coffee, Other guidelines.pdf
One really useful thing in here is how to describe "Value Added" to visitors.
Entry  Fri Jul 28 17:57:06 2017, Brian Clark and Ian Best , ,  
 
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