Updates and Results Talks and Posters Advice Ideas Important Figures Write-Ups Outreach How-To Funding Opportunities GENETIS
  GENETIS, Page 3 of 14  ELOG logo
ID Date Author Subjectdown Text Attachments
  14   Mon Jul 1 13:45:49 2019 Alex PattonStatus on optimizing AraSimWe ran valgrind (a profiler) on AraSim
to find out where it was spending most of
its time, we ran it with callgrind to give
 NewFilesAndResults.zip 
  129   Thu Mar 11 15:41:52 2021 Alex MRunning The Loop UpdatedBecause of issues we were having with XF
when running at the command line, we've
shifted to running through a Pitzer VDI (see
  
  141   Fri Feb 4 16:10:32 2022 Julie RollaRun Log TemplateFor PAEA Algorithm:

Part
I: Complete as soon as the run starts

Run
details: Please answer all of the
  
  163   Tue Jun 21 12:02:23 2022 Alex MRun Details: Machtay_20201023_300K_Nus_50_IndividualsThis run was started on 10/23/2020. The
purpose was to attempt to demonstrate
evolution by beginning from 50 identical
 Fitness_Scores_RG.png 
  Draft   Tue Jun 28 11:40:32 2022 Alex MRun Details: Machtay_20200911_SymmetricThis was a symmetric run that began on
9/11/2020. This run used fewer neutrinos
to determine how significant the number would
 Fitness_Scores_RG.png 
  167   Tue Jun 28 11:35:15 2022 Alex MRun Details: Machtay_20200831_Asym_Length_and_AngleThis run was conducted beginning on August
31, 2020.

Both the angle and length were
 Fitness_Scores_RG.png 
  165   Tue Jun 21 12:22:02 2022 Alex MRun Details: Machtay_20200827_Asym_Length_RunThis run followed the first symmetric run.
It had an asymmetric length, but the opening
angle and inner radius were kept symmetric. 
 Veffectives_RG.pngFitness_Scores_RG.png 
  164   Tue Jun 21 12:15:18 2022 Alex MRun Details: Machtay_20200824_Real_RunThis is considered to be the first run
of "good" data. Prior to this
run, we ran with few neutrinos and had errors
 Fitness_Scores_RG.pngVeffectives_RG.png 
  159   Tue Jun 7 11:29:48 2022 Alex MRun Details: AraSim_Polarity_Fix_2021_03_19This is the run that is discussed in the
GENETIS paper submitted to Physical Review
D in December of 2021. It was conducted beginning
 Run_Notes.txtViolin_Plot_super_big.png 
  188   Fri Dec 30 01:16:52 2022 Alex MRun Details: 2022_12_29We began a new run of the curved sided
GA. Previously, we conducted a run just like
this in July of 2022 (titled 2022_07_15_Latest_Greatest).
 run_details.txt 
  174   Fri Jul 15 18:33:20 2022 Alex MRun Details: 2022_07_15_Latest_GreatestWe have started a new run. Here is the
directory: /fs/ess/PAS1960/BiconeEvolutionOSC/BiconeEvolution/current_antenna_evo_build/XF_Loop/Evolutionary_Loop/Run_Outputs/2022_07_15_Latest_Greatest

This run is a substantial overhaul.
 run_details.txt 
  160   Tue Jun 7 12:20:23 2022 Alex MRun Details: 2022_04_14_Identical_Asym_Lower_MinThis run was a short run (stopped due to
resource limits) that was conducted to test
the minimum length constraint that had been
 run_details.txtViolin_Plot.png2022_04_14_Identical_Asym_Lower_Min_Rainbow.png 
  158   Tue Jun 7 11:01:59 2022 Alex MRun Details: 2022_02_08_Rank_TestThis run was started on February 2, 2022.
It is a full run of 50 generations with 50
individuals per generation using the quadratic
 run_details.txtViolin_Plot.png 
  186   Mon Nov 28 10:44:27 2022 Alex MRun Details Latest_Greatest_2022_11_26Here are the changes that have been made
in this (and the preceding) run relative
to what we have been doing before.
 run_details_2022_11_26.txt 
  201   Tue Mar 7 00:06:57 2023 Bryan ReynoldsRetroactive AREA update: January 18, 2022 AREA run- No linear freq. dependence test w/ increased NPopThe following is a
run summary of an AREA test using 100 individuals
per generation, without the linear frequency
 20230201_singleFreqTest_100NPop_fitnessPlot_10Gens.PNG20230410_AREA_mostFitIndivReUpload_singleFreqTest.PNG 
  200   Mon Mar 6 23:25:12 2023 Bryan ReynoldsRetroactive AREA update: December 26, 2022 AREA run- No linear freq. dependence testThe following is a run summary of the AREA
test without the linear frequency dependence
on the gain, with the frequency fixed (i.e.
 20230109_singleFreqTest_fitnessPlot_update30Gens.PNG20221229_singleFreqTest_overallBestIndiv_gen12Indiv17.PNG 
  213   Thu Apr 27 01:36:32 2023 Alex MResults from paper symmetric runThe reviewer asked us to run the loop again
but for just symmetric antenna designs. We
have completed that run and have results
 Violin_Plot.png 
  24   Mon Dec 2 16:41:35 2019 Julie RollaRequesting an interactive jobRequesting an interactive job:

 

qsub -I -X -l walltime=1:00:00
  
  144   Tue Feb 8 15:56:42 2022 MachtayRank Test RunI fixed a bug in the loop, so we started
another rank test run. Run details in the
attached file.
 run_details.txt 
  Draft   Mon May 29 20:21:07 2023 Dylan WellsPueo Physics of Results PlotsThe Physics of Results Plots have been
added to the Pueo Loop. The current version
of the plotter is built for pueoSim
 7x 
ELOG V3.1.5-fc6679b