Updates and Results Talks and Posters Advice Ideas Important Figures Write-Ups Outreach How-To Funding Opportunities GENETIS
  GENETIS, Page 7 of 13  ELOG logo
Entry  Thu Apr 2 16:14:29 2020, Julie Rolla, GENETIS Meeting update Fitness_Score.png
This is a general update. Most of our recent meetings have been to teach the students to use Git properly, or to answer questions on the training modules. 

 

Update 

1. Git Update: I recently cleaned up our Git and GitHub so that we have
Entry  Tue Apr 7 15:48:54 2020, Julie Rolla, GENETIS Meeting Update 
Meeting Attendance: Julie, Alex M., Alex P, Eliot, Leo, Evelyn, Mitchell, Ryan. 

Today is the deadline for confirming our attendance at the virtual APS meeting. Alex M. will be confirming and we will be orienting ourselves
so that we can have some results. Here is our to-do list for today:
Entry  Mon Apr 13 14:43:54 2020, Julie Rolla, GENETIS Meeting Update 
Note that Pitzer usage over the weekend was much better! Maybe weekends are our best time to run? Today (Monday) has been a little bit worse. 

Over the past few days the following items have been accomplished:


We got the jobs to stop canceling on OSC.

Issue was the destination command for the error and output files for the
Entry  Thu May 7 14:35:00 2020, Julie Rolla, GENETIS Meeting Update 
The students have been meeting to work out the summer schedule. We are dividing into to groups:

(1) Paper writing: Julie, Alex M., Alex. P


We need Amy to start an overleaf draft (she has the premium version that allows you to share with more than 1 person)



Entry  Mon May 11 17:56:36 2020, Julie Rolla, GENETIS Meeting Update 
We met today for a long time and pushed to catch up. The following is what we have done:

(1) Worked for a bit on our current tasks. They will work on these current tasks before they start on their summer projects. 


Antenna database (Julie, Alex P., Alex M.)
Worked on a paper outline (Julie, Alex M.)
Worked on wall time variable
Entry  Sat Nov 30 22:04:30 2019, Julie Rolla, GENETIS Loop Work: Fixing Consol Errors 
GENETIS Loop Work: Fixing Consol Errors By Julie Rolla

1. Python programs are not running: I think either (1)
the user isn't module loading python, or (2) they are loading the wrong version of Python (remember there's a discrepancy for Python2, and Python3). 
Entry  Mon Mar 27 13:10:02 2023, Alex M, GENETIS Hackathon Summary and Next Steps Weird_PUEO_Model.png
This entry will serve to summarize what tasks we've completed and still need to complete after last week's GENETIS hackathon.

Alex

My focus was on the XF scripting for making the PUEO antenna. Before last week, we had a script which made the geometry of a PUEO-like antenna.
Entry  Tue Mar 21 17:58:21 2023, Alex M, GENETIS Hackathon Day 2 ANITA_Gain_X.pngANITA_Gain_Y.pngANITA_Gain_Z.pngTop_Down_ANITA.png
Today was day two of the GENETIS hackathon. See the previous entry for details on day one. 

 

Alex
Entry  Mon Mar 20 17:32:42 2023, Alex M, GENETIS Hackathon Day 1 ANITA_Antenna_Project.xmacroANITA_Horn.pngANITA_Gain_Pattern_Both_Sources.png
Today was the first day of the GENETIS Hackathon. We are spending several days this week specifically tackling the PUEO project to get it into full form
(or close to it). Here is a progress update after day 1.

 
Entry  Tue Apr 6 18:00:23 2021, Julie Rolla, GENETIS Google Drive with Talks/Posters, Grant writings, Papers 
https://drive.google.com/drive/folders/1iDamk46R2_oOLHtvsOg4jNy05mCiB7Sn?usp=sharing
Entry  Tue May 19 12:20:40 2020, Alex Patton, GENETIS Daily Updates 
Today's Summer 2020 daily update:

As a note, today OSC was down so productivity was more limited




Name
Update for Today
Plans for Tomorrow


Alex
M.

Mostly just wrote more on the paper in the Genetic Algorithm section. I added some citation that we used in ICRC but there are
Entry  Thu May 28 15:11:35 2020, Alex Patton, GENETIS Daily Update 5/28/2020 



Name
Today's Update
Plans for Tomorrow


Alex
M.

I wasn't available Thursday or Friday morning.

My goal on Friday is to help Alex P. more with finding the cause of the 0 effective volumes we're getting (and also the high
Entry  Mon May 18 15:13:13 2020, Julie Rolla, GENETIS Daily Update  
Today's Summer 2020 daily update:

 




Name
Update for Today
Plans
for Tomorrow


Alex M.

(See Alex P. for details on working on fixing loop issues)
Entry  Wed May 20 10:59:29 2020, Alex Patton, GENETIS Daily Update 
Today's Summer 2020 daily update:

 

Learn how to use the final part of the loop




Name
Update for Today
Plans for Tomorrow


Alex
Entry  Thu May 21 14:31:08 2020, Alex Patton, GENETIS Daily Update 
Today's Summer 2020 daily update:

 




Name
Update for Today
Plans for Tomorrow


Alex
M.

Continued the run testing the XF fixes with Alex P. We think our fixes are working, but we want to get a few more generations through.
Entry  Sun Apr 19 21:16:21 2020, Alex Machtay, GENETIS APS Slides Genetis_APS_Presentation.pptxGenetis_APS_Presentation.pdf
Here's the presentation we gave for the April APS meeting today. Atttached is the power point of the presentation and a pdf version. 
Entry  Tue Aug 9 11:36:24 2022, Ryan Debolt, GA User guide (pdf) VPol_GA_User_guide.pdf
 
Entry  Fri Feb 4 17:59:41 2022, Ryan Debolt, GA Updates Original_Params.PNGRank_params.PNGRange_restriction.PNGMutation.PNG
The following plots are ittereations if the test loop that add increasing improvements to the GA.

The first plot shows the GA's behavoir unaltered from our previous runs (80% roulette, 20% tournament elite selection on).

The second plots shows when we use 90% rank selection and 10% tournament, elite selection off.
Entry  Fri May 20 14:26:39 2022, Alex M, GA Papers 
I'm making this entry so that I can record some interesting papers we find on genetic algorithms. Feel free to update this list with links to papers
and maybe make a description of what was interesting/of note in the paper.
 
Entry  Fri Aug 21 15:19:10 2020, Ryan Debolt, Friday Updates 



Name
Update
Plans for next week


Alex
M
 
 


Alex P
 
 


Eliot
 
 


Leo
 
 


Evelyn
 
 


Ryan
This
week I completed work on a set of graphs that shows many instances of of a run type on a graph to show the spread that runs give. I am still working on
ELOG V3.1.5-fc6679b