Updates and Results Talks and Posters Advice Ideas Important Figures Write-Ups Outreach How-To Funding Opportunities GENETIS
  GENETIS, Page 9 of 13  ELOG logo
Entry  Fri May 29 17:36:04 2020, Alex Machtay, Daily Update 



Name
Today's Update
Plans
for Monday


Alex M

I wasn't available in the morning. I met with Amy and Alex P around 1 to talk
about how to use the AraSim function for throwing the same neutrinos to search for bugs in the loop. We want to compare three types of antennas we've
Entry  Tue Jun 9 15:00:09 2020, Alex Machtay, Daily Update 6/9/20 



Name
Today's Update
Plams
for Tomorrow


Alex M

Alex P and I kept working on finding differences in AraSim between antennas. We
still haven't found any and we've checked: electric field, maximum peak voltage, effective height, threshold (factor and offset), and the fft (and
Entry  Wed Jun 10 15:47:43 2020, Alex Machtay, Daily Update 6/10/20 



Name
Today's Update
Plans
for Tomorrow


Alex M
I wasn't available for most of the day, but I jumped onto the meeting to help Alex P
continue looking for the problem with the effective volumes. Amy asked us to investigate the phase responses coming out of XF. I posted the plots in the
Entry  Wed Jun 17 17:21:16 2020, Alex Machtay, Daily Update 6/17/20 



Name
Update for Today
Plans for
tomorrow


Alex M
Worked more with Alex P on AraSim. We've found the cause of the low effective volumes. The
function GainToHeight in Report.cc uses another function called GetGain_1D_OutZero in Detector.cc. The problem is that for some small individuals, we get
Entry  Fri Jun 19 16:27:53 2020, Alex Machtay, Daily Update 6/19/20 



Name
Today's Update
Plans
for Monday


Alex M
Ran the loop with the same individuals in each "generation" to test how decreasing
the grid size would affect the effective volume. Using individuals with lengths of 5cm, I startde with a grid spacing of 0.01 cm and kept cutting down
Entry  Wed Jul 12 21:30:56 2023, Alex Machtay, Zoom training on XF 07/12/23 
Recording of training on XFdtd by Alex Machtay on July 12, 2023.

Entry  Tue Jun 16 16:10:52 2020, Alex M, Daily Update 6/16/20 




Name
Update for today
Plans
for Tomorrow


Alex M
Continued working to find the AraSim error. We think we're very close to finding where
the difference between the two individuals (one with nonzero effective volume, one with 0) is arising. We've pinned it down to a series of if statements
Entry  Fri Jun 26 16:13:18 2020, Alex M, Daily Update 



Name
Today's Update
Plans
for Monday


Alex M
Worked to run the loop with Alex P to test a smaller initial mean and standard deviation of
the opening angle. Worked some more on the paper too--I fixed some citations issues (and found some good ones to add) but the references are still spilling
Entry  Tue Jun 30 17:12:32 2020, Alex M, Daily Update 6/30/20 



Name
Update for Today
Plans for
Tomorrow


Alex M
Continued looking in XF for why the frequency where two antennas separated by a small amount
give the same gain. I made a script which plots the gain at each frequency for a chosen number of individuals at a specific polar angle and used it on
Entry  Wed Jul 1 16:18:35 2020, Alex M, Daily Update 7/1/20 



Name
Today's Update
Plans
for Tomorrow


Alex M
Worked to make the frequency plots up to ~2.5 GHz. Amy said we should put a cut off for
the length of the antennas based on the minimum frequency, but right now I'm not sure how to find what that minimum length should be based on the frequency
Entry  Mon Jul 6 16:49:21 2020, Alex M, Daily Update 



Name
Update for Today
Plans for
Tomorrow


Alex M

Fixed up a few more errors in the new roulette algorithm with the length cut. Started
a run to test the loop. 
Entry  Thu Jul 9 16:54:27 2020, Alex M, Daily Update 7/9/20 



Name
Update
Plans for Tomorrow


Alex
M

Finished running the loop for 15 generations. The last plots are on Dropbox under Length_Cutoff_Test_3. There are three things to
fix before running this version of the loop again. See below the table.
Entry  Fri Jul 10 16:35:26 2020, Alex M, Daily Update 7/10/20 



Name
Update
Plans for Monday


Alex
M

Yesterday we started a run of the database version of the loop. The goal was to use it to replicate the results from the run we
finished yesterday using the same parameters (NPOP=8, SEEDS=10, bicone separation = 0.05 cm). We initially ran into problems with the databse which we
Entry  Mon Jul 13 15:34:40 2020, Alex M, Daily Update 7/13/20 



Name
Update
Plans for Tomorrow


Alex
M

Alex and I continued running the loop for the database test. We ran into an error over the weekend that was affecting generations
after gen 0. Alex fixed it this morning and continued the run. 
Entry  Fri Jul 17 18:09:16 2020, Alex M, Daily Update 7/17/20 



Name
Update
Plans for Monday


Alex
M

We may have found the error in the asymmetric bicone. It appears there may have been two problems. First, the setup for the simulation_PEC.xmacro
script in the asymmetric version appears to have been slightly different in that the positions of the cones, relative to the positions of the coordinate
Entry  Mon Jul 20 17:01:35 2020, Alex M, Daily Update 7/20/20 



Name
Update
Plans for tomorrow


Alex
M

The arasim jobs I submitted over the weekend kept failing. I've been looking for the cause but I can't pinpoint it right
now. The issue arose on Friday when I overwrote the version of Report.cc on Eliot's user with the one we have on the databse branch (but I don't
Entry  Tue Jul 21 17:01:58 2020, Alex M, Daily Update 7/21/20 



Name
Update
Plans for tomorrow


Alex
M
I replaced AraSim on Eliot's user with the one we have on the shared space since I wasn't able to compile his yesterday. It compiled
correctly and I ran the loop but got the same results from last week (effective volumes that differed from the ones we got in the original and database
Entry  Wed Jul 22 16:00:18 2020, Alex M, Daily Update 7/21/20 



Name
Update
Plans for Tomorrow


Alex
M
Leo and I worked on the roulette algorithm to figure out why the new individuals being formed are different in the asymmetric bicone version
of the loop than the original and database versions. We made some fixes, but we came across a complicated problem. Essentially, we think that the difference
Entry  Thu Jul 23 16:44:05 2020, Alex M, Daily Update 7/23/20 



Name
Update
Plans for Tomorrow


Alex
M

Leo and I continued working on the roulette algorithm for the asymmetric bicone to try to get the evolved generations to match the
original and database ones. We went through the mutation part of the algorithm and made sure we were rrunning all of the random number sequences in the
Entry  Fri Jul 24 16:25:06 2020, Alex M, Daily Update 7/24/20 



Name
Update
Plans for Monday


Alex
M
 
 


Alex P
 
 


Eliot
 
 


Leo
 
 


Ryan
 
 


Evelyn
 
 


Ben
 
 


Ethan
 
 




 
ELOG V3.1.5-fc6679b