Updates and Results Talks and Posters Advice Ideas Important Figures Write-Ups Outreach How-To Funding Opportunities GENETIS
  GENETIS, Page 11 of 13  ELOG logo
Entry  Tue Jun 2 13:42:21 2020, Alex Patton, Daily GENETIS Update 6/2/20 



Name
Today's Update
Plans for Tomorrow


Alex
M.

Worked with Alex on trying to compare bicones to the ARA bicone. Met with Ben to give him some things to look over and told him
to come to the meeting tomorrow at 1.
Entry  Mon Jun 1 15:21:03 2020, Alex Patton, Daily ELOG Update 6/1/2020 



Name
Today's Update
Plans for Tomorrow


Alex
M.

Spoke with Evelyn and Ryan about the paperclip antennas. They found the github repository with the files and a README so they're
getting started on learning about the algorithm and testing out the scripts. Once they play with it and can get it running they'll start running it
Entry  Fri May 29 17:36:04 2020, Alex Machtay, Daily Update 



Name
Today's Update
Plans
for Monday


Alex M

I wasn't available in the morning. I met with Amy and Alex P around 1 to talk
about how to use the AraSim function for throwing the same neutrinos to search for bugs in the loop. We want to compare three types of antennas we've
Entry  Thu May 28 15:11:35 2020, Alex Patton, GENETIS Daily Update 5/28/2020 



Name
Today's Update
Plans for Tomorrow


Alex
M.

I wasn't available Thursday or Friday morning.

My goal on Friday is to help Alex P. more with finding the cause of the 0 effective volumes we're getting (and also the high
Entry  Wed May 27 15:00:28 2020, Alex Patton, Daily ELOG Update 5/27/2020 



Name
Today's Update
Plans for Tomorrow


Alex
M.

Met with Alex P. and Amy to think about how we can make sure the data coming from AraSim makes sense (specifically, to figure out
why we're getting effective volumes of 0 on some antennas). Amy suggested we use a function in AraSim that let's us simulate identical events so
Entry  Tue May 26 16:38:26 2020, Alex Machtay, Daily Update 



Name
Today's Update
Plans
for Tomorrow


Alex M.
Continued working on fixing bugs with Alex P. I had a run from over the weekend which got
through a few generations, but we're suspicious because the effective volumes are very high despite the antenna dimensions being very small. I made
Entry  Thu May 21 14:31:08 2020, Alex Patton, GENETIS Daily Update 
Today's Summer 2020 daily update:

 




Name
Update for Today
Plans for Tomorrow


Alex
M.

Continued the run testing the XF fixes with Alex P. We think our fixes are working, but we want to get a few more generations through.
Entry  Wed May 20 10:59:29 2020, Alex Patton, GENETIS Daily Update 
Today's Summer 2020 daily update:

 

Learn how to use the final part of the loop




Name
Update for Today
Plans for Tomorrow


Alex
Entry  Wed May 20 10:58:38 2020, ,  
Today's Summer 2020 daily update:

As a note, today OSC was down so productivity was more limited




Name
Update for Today
Plans for Tomorrow


Alex
M.

Mostly just wrote more on the paper in the Genetic Algorithm section. I added some citation that we used in ICRC but there are
Entry  Tue May 19 12:20:40 2020, Alex Patton, GENETIS Daily Updates 
Today's Summer 2020 daily update:

As a note, today OSC was down so productivity was more limited




Name
Update for Today
Plans for Tomorrow


Alex
M.

Mostly just wrote more on the paper in the Genetic Algorithm section. I added some citation that we used in ICRC but there are
Entry  Mon May 18 15:13:13 2020, Julie Rolla, GENETIS Daily Update  
Today's Summer 2020 daily update:

 




Name
Update for Today
Plans
for Tomorrow


Alex M.

(See Alex P. for details on working on fixing loop issues)
Entry  Mon May 11 17:56:36 2020, Julie Rolla, GENETIS Meeting Update 
We met today for a long time and pushed to catch up. The following is what we have done:

(1) Worked for a bit on our current tasks. They will work on these current tasks before they start on their summer projects. 


Antenna database (Julie, Alex P., Alex M.)
Worked on a paper outline (Julie, Alex M.)
Worked on wall time variable
Entry  Thu May 7 14:35:00 2020, Julie Rolla, GENETIS Meeting Update 
The students have been meeting to work out the summer schedule. We are dividing into to groups:

(1) Paper writing: Julie, Alex M., Alex. P


We need Amy to start an overleaf draft (she has the premium version that allows you to share with more than 1 person)



Entry  Sun Apr 19 21:16:21 2020, Alex Machtay, GENETIS APS Slides Genetis_APS_Presentation.pptxGenetis_APS_Presentation.pdf
Here's the presentation we gave for the April APS meeting today. Atttached is the power point of the presentation and a pdf version. 
Entry  Mon Apr 13 14:43:54 2020, Julie Rolla, GENETIS Meeting Update 
Note that Pitzer usage over the weekend was much better! Maybe weekends are our best time to run? Today (Monday) has been a little bit worse. 

Over the past few days the following items have been accomplished:


We got the jobs to stop canceling on OSC.

Issue was the destination command for the error and output files for the
Entry  Tue Apr 7 15:48:54 2020, Julie Rolla, GENETIS Meeting Update 
Meeting Attendance: Julie, Alex M., Alex P, Eliot, Leo, Evelyn, Mitchell, Ryan. 

Today is the deadline for confirming our attendance at the virtual APS meeting. Alex M. will be confirming and we will be orienting ourselves
so that we can have some results. Here is our to-do list for today:
Entry  Thu Apr 2 16:14:29 2020, Julie Rolla, GENETIS Meeting update Fitness_Score.png
This is a general update. Most of our recent meetings have been to teach the students to use Git properly, or to answer questions on the training modules. 

 

Update 

1. Git Update: I recently cleaned up our Git and GitHub so that we have
Entry  Tue Mar 24 15:38:50 2020, Julie Rolla, X11 Forwarding Issue for Windows 
Most of our students 

(1)Ubuntu doesn't come with X11 forwarding on its own. So you can install Xlaunch


xeyes -display :0

 
Entry  Fri Mar 6 15:01:37 2020, Julie Rolla, GENETIS Working Meeting 
Attendance: Julie, Evelyn, Mitchell, Ryan, Alex M.

Since we have been having issues with the lack of availability of GPUs on OSC, we have come up with a new to-do list:


Try to keep running on Pitzer with 1 core instead of 40. Based on first attempts, it is saying this will reduce wait times to ~3 hours
Entry  Wed Mar 4 01:00:35 2020, Julie Rolla, GENETIS Working Meeting 03/03/2020 
Attendance: Julie, Mitchell, Ryan, Alex P., Leo, Alex M.

Today's Tasks

Mitchell: Worked on Python Project and helped with Ryan's final bash
project questions
ELOG V3.1.5-fc6679b