Updates and Results Talks and Posters Advice Ideas Important Figures Write-Ups Outreach How-To Funding Opportunities GENETIS
  GENETIS, Page 6 of 13  ELOG logo
Entry  Tue Aug 9 15:28:50 2022, Ryan Debolt, How many individuals to use in the GA. 
One of our foundational questions tied to the optimization of the GA has been "How many individuals should we simulate". Up to now, our minds
were made up for us by the speed of arasim being great enough that the time cost of simulating individuals was great enough that the improvements made
from having more were not enough to justify the slowdown. However, with the upgrade to the faster, more recent version of arasim, I decided to re-examine
Entry  Wed Apr 5 17:21:07 2023, Nick King, H-pol XF Design Screenshot_(7).pngScreenshot_(8).pngHpolfromScript(5_10_2023).pngStephHpolwith_just_copper_plates_and_wires.png
Work in progress. Update on H-pol XF design. The first plot is the gain pattern with ferrite rod sets (blue) vs. with nothing but the copper plates. 
The second plot is the gain pattern with everything but the ferrite rod sets vs. with nothing but the copper plates.
The ferrite rod sets function to narrow the gain pattern.
Entry  Thu Jun 1 21:49:29 2023, Dylan Wells, Guide to Updating pueoSim  
How To Update PueoSim For GENETIS:

 

First, whoever updates pueoSim needs access to pueoBuilder, pueoSim, and niceMC on GitHub (ask Will for permissions).
Entry  Wed Dec 2 15:24:39 2020, Alex M, Guide for Loop Errors Loop_Error_list.txt
Attached is a .txt file you can find in the Evolutionary_Loop directory as Loop_Error_List.txt. It's a list of the current errors we sometimes experience
in the loop, along with how to fix them if you encounter them while running. If people encounter errors that aren't in the list, let everyone know
in the #genstudents chat on slack and update the file with the error message and when it was encountered (what state the loop was in) and the possible
Entry  Mon Jun 5 15:00:07 2023, Ryan Debolt, Github tests 
We want to automate tests in pull requests in GitHub to run unit tests on individual functions to ensure they return the expected results. This will
help prevent bugged code from being pushed to working branches. We will add a list of unit tests to this ELOG as we design them.

 
Entry  Thu Jun 29 12:05:45 2023, Alex M, Gain at various source heights 17x
Here are a collection of antenna gain patterns with the antenna power source located at various heights at 500 MHz. The heights are indicated in the
name of the images and were located at 3cm, 6cm, 12cm, and 24cm from the base. One thing to note is that the power source becomes longer as a function
of height (since it's connected to the ridges, which slope back). 
Entry  Tue Feb 4 17:17:10 2020, Julie Rolla, GENETIS working meeting  project_description.pdfproject_summary.pdf
As of 01/30/2020, the proposal was submitted! The project description and summary are attached below. 

Bicone Loop Status Update: 

The loop currently runs; however, it does seem
that if AraSim jobs are left to run while the user is away, it doesn't properly write one or more of the flags, and makes the loop get stuck at
Entry  Wed Feb 6 17:36:24 2019, Julie Rolla, GENETIS update 2/6 
Atttendance: Julie, Max, Cade, Suren, Evelyn, Sophie

 

Today's tasks:
Entry  Wed Mar 29 18:36:29 2023, Alex M, GENETIS Working Meeting Update Modeling_ANITA_Ridges.nb
This is an entry for the usual Wednesday working meeting GENETIS holds. We are largely carrying on from last week's hackathon hammering out the remaining
pieces that need to be fixed. See the previous ELOG post for a list of those.

Alex
Entry  Wed Mar 4 01:00:35 2020, Julie Rolla, GENETIS Working Meeting 03/03/2020 
Attendance: Julie, Mitchell, Ryan, Alex P., Leo, Alex M.

Today's Tasks

Mitchell: Worked on Python Project and helped with Ryan's final bash
project questions
Entry  Mon Feb 10 14:20:56 2020, Julie Rolla, GENETIS Working Meeting  
Today's Tasks

Julie: Write bash practice assignment, assist others when they have questions, work on Git lecture.
(Will finish bash assignments early next week)
Entry  Wed Feb 12 01:18:22 2020, Julie Rolla, GENETIS Working Meeting  
Today we continued with the to-do lists items previously posted. I marked all the to-do list items that have been completed with green
and a slash. Note that I have also added a new item at the bottom of the to-do list.

 
Entry  Fri Feb 14 16:44:44 2020, Julie Rolla, GENETIS Working Meeting  
Today's Tasks

Julie: Write Python project! I have officially finished the bash course for the students.
It can be found here: https://docs.google.com/document/d/1nGdPrwfYJOrO6NBT76Wsh6T0hDmGHo2-23oJ1WyeNcs/edit?usp=sharing. Mitchell
is currently trying it out and will give me comments. 
Entry  Tue Feb 18 16:20:59 2020, Julie Rolla, GENETIS Working Meeting  
Today's Tasks

Julie: Continue writing Python project! 

Mitchell, Evelyn, Eliot (not here on Tuesdays), Ryan: Work through bash project

Leo: continuing gathering information for the "physics of antennas" lecture series! We start this Friday
Entry  Fri Feb 21 16:47:21 2020, Julie Rolla, GENETIS Working Meeting  
Today's Tasks

Julie: I finished the Python assignment. I am making sure my solutions encompass all of the different
ways to solve this, and will then start on the C++ project. 

Mitchell, Evelyn, Eliot, Ryan: Work through my bash project.
Entry  Sat Feb 29 02:21:16 2020, Julie Rolla, GENETIS Working Meeting 
Attendance: Julie, Mitchell, Ryan, Evelyn, Eliot, Alex M.

Today's Tasks

Julie: Worked on C++ project, and helping others with the Python project; I also
made additions, clarifications, and edits to the Bash project (also updated the solutions and pushed them to gitHub). I still need to do the following:
Entry  Fri Mar 6 15:01:37 2020, Julie Rolla, GENETIS Working Meeting 
Attendance: Julie, Evelyn, Mitchell, Ryan, Alex M.

Since we have been having issues with the lack of availability of GPUs on OSC, we have come up with a new to-do list:


Try to keep running on Pitzer with 1 core instead of 40. Based on first attempts, it is saying this will reduce wait times to ~3 hours
Entry  Mon Sep 14 17:23:26 2020, Alex M, GENETIS Update 9/14/20 
I just wanted to give an update on what I've been doing today for GENETIS. I went ahead and recorded myself running the loop. It should be useful
for new people we're onboarding but I also went through a whole generation, which I think is interesting for everyone to understand the timescale of
each part of the loop. I'm making a small edit (I have no clue how to edit videos haha) so once I'm done I'll try to send it via email and
Entry  Tue Mar 17 16:18:29 2020, Julie Rolla, GENETIS Planning Meeting  
Attendance: Julie Rolla, Alex M. 

Today Alex and I met to discuss how to move forward given the COVID-19 restrictions. We have resent out a message polling people's schedules
to create online working sessions. Here is what we are planning:
Entry  Wed Feb 6 17:23:18 2019, Julie Rolla, GENETIS Paper working draft IMG_2881.JPG.jpeg
The current working draft of the GENETIS paper can be seen here: https://www.overleaf.com/6783528497tvqbjphsgvzn

 

Additionally, here's our outline for the paper. The section assignments are as follows:
ELOG V3.1.5-fc6679b