Updates and Results Talks and Posters Advice Ideas Important Figures Write-Ups Outreach How-To Funding Opportunities GENETIS
  GENETIS, Page 6 of 13  ELOG logo
Entry  Mon Oct 24 16:07:22 2022, Dylan Wells, Creating the matching circuit design 
The first part of designing the matching crictuit was choosing a frequency range to match over. We chose 100 MHz to 1000 MHz.

The geometric mean of this range in 316.227 MHz, which is the ideal frequeny to match to.

Then, we need the impedance of the antenna we are matching to.
Entry  Mon Dec 5 17:46:40 2022, Dylan Wells, Constraints on PUEO evolved antennas  
Variables of Evolved Antennas

Wall variables:
S -- length of bottom of the walls
m -- slope of the walls (currently set to 1)
Entry  Mon Feb 6 10:23:53 2023, Dylan Wells, Matching Circuit Parts  
Attached is a spreadsheet with the information on the parts we need for the N=14 matching circuit board.

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1x8dX3tNE-WSHjH_slj_EH4XsHcAnCVC05XiRBFPtIUc/edit#gid=0
Entry  Mon Feb 6 13:20:26 2023, Dylan Wells, Physical Paramaters for the best antenna 
Asym Straight Sides (from the paper - Generation 23, Individual 8)

(inner radius, length, opening angle in radians)


2.08711,89.924,0.0161734
0.30175,45.3616,0.0910478

individual found in 
Entry  Mon Mar 6 00:07:32 2023, Dylan Wells, Current Status of PUEO and To Do List for Hackathon  
I went through the current PUEO Loop  and documented everything that
still needs to be accomplished before we can run.

Everything is compiled in this Google
Entry  Mon Apr 24 13:09:36 2023, Dylan Wells, PUEO Plots Status 7x
Plots we want to have for PUEO:

FScorePlot2D

Fitness_Scores_RG
Entry  Mon May 29 20:21:07 2023, Dylan Wells, Pueo Physics of Results Plots 7x
The Physics of Results Plots have been added to the Pueo Loop. The current version of the plotter is built for pueoSim v1.0 and located in ${WorkingDir}/Antenna_Performance_Metric
(Hasn't been pulled into the loop directory yet).

The pueoSim v1.0 IceFinal files were missing information on the RF direction and information needed to see an amplitude spectrum. I asked Will,
Entry  Thu Jun 1 21:49:29 2023, Dylan Wells, Guide to Updating pueoSim  
How To Update PueoSim For GENETIS:

 

First, whoever updates pueoSim needs access to pueoBuilder, pueoSim, and niceMC on GitHub (ask Will for permissions).
Entry  Sun Jun 18 21:32:03 2023, Dylan Wells, Default Toyon Antenna Simulation 248599981-8eacbc83-d42e-4da4-9746-bda05b2b4a38.png248599974-bee7a4db-34c6-4cfd-bde0-3682ff3ebaf7.png
To act as our comparison to the evolved antennas while plotting, we have done a simulation of pueoSim with 4,000,000 neutrinos for the measured toyon
gains found in /fs/ess/PAS1960/buildingPueoSim/pueoBuilder/components/pueoSim/data/antennas/measured

In order to run the jobs, I used the runJobs.sh script found in /fs/ess/PAS1960/buildingPueoSim which submits job runs of 40,000 neutrinos
Entry  Tue Jul 18 22:04:22 2023, Dylan Wells, Parallelizing pueoSim jobs 
Currently, the PUEO loop runs pueoSim with 1 pueoSim process per job submitted.

Each of these jobs has 1 node and 8 cores, however, pueoSim only needs a single core to run.

Here is some data I collected by running the same seed of pueoSim with different numbers of cores in the job:
Entry  Tue Jul 25 16:07:25 2023, Dylan Wells, Parallelizing XF and pueoSim in the loop 
Standard Loop Architecture:

Complete an evolutionary step FOR EACH antenna before continuing on with the next step.

Steps:
Entry  Wed Aug 2 12:49:57 2023, Dylan Wells, Line of Best-Fit Straightened Sides Antenna output.pngimage_(3).pngoutput.png
Previously, we have tried to straighten the sides of the best-evolved curved antenna in elog
229. However, there were potential issues with how closely this line resembled the curve of the antenna.

So, I attempted to create another straightened sides antenna using a linear regression model to find the best fitting line for the curve to create
Entry  Mon Oct 7 15:35:01 2024, Dylan Wells, Template Run Results Slide Deck 
Copy this slide deck to use when presenting on run updates!

https://docs.google.com/presentation/d/1Tk-B1QbFTP_5pQZovfn0_wbTswZTmOrJURpi374xJWo/edit?usp=sharing
Entry  Sun Oct 20 13:11:09 2024, Dylan Wells, OSU Physics Scholarship Opportunities 
Here are some scholarships available to physics majors I've been lucky enough to receive throughout undergrad that allowed me to work on this project
unpaid without needing supplemental income from a separate job or loans. 

1. OSU
Entry  Mon Feb 20 12:33:20 2023, Dennis H. Calderon, AraSim Simulations for Top 5 Antennas (12/2022) with Higher Stats Crazy_Sides_Triggered_Event_Data.pdf
AraSim Simulations for Top 5 Antennas from 12/2022 Run with 3 million simulated events

Simulated using Arasim version currently used in GENETIS Loop

/fs/ess/PAS1960/BiconeEvolutionOSC/AraSim/
Entry  Tue Jun 28 12:49:53 2022, Dennis Calderon, Effective Volumes from AraSim: Curved Sides and Straight Sides (Paper Run) AraSim_Summary_Effective_Volumes.pdf
Summary of results for 3million event simulations in AraSim with both GENETIS version and more recent {~11/2021) version.

Using errors for effective volume from the .out files.

Example shown below.
Entry  Fri Aug 5 09:59:07 2022, Dennis Calderon, Updated Effective Volumes and Errors (Paper Run and Curved Sides) Effective_Volumes_Errors_2.pdffull_resimulate_DNA.csvoriginal_best_curved.pngbest_curved_quad_zero.pngbest_curved_same_radii.png
Update to previous ELOG post for Effective Volumes and Errors for AraSim simulations for antennas from Paper_Run and Curved_Sides.

AraSim version compiled ~11/2021 and the (old) GENETIS version

 
Entry  Thu Nov 7 16:55:00 2019, Cade Sbrocco, Archiving Old Genetis Manual GENETIS_Manual.pdf
 
Entry  Mon Mar 6 23:25:12 2023, Bryan Reynolds, Retroactive AREA update: December 26, 2022 AREA run- No linear freq. dependence test 20230109_singleFreqTest_fitnessPlot_update30Gens.PNG20221229_singleFreqTest_overallBestIndiv_gen12Indiv17.PNG
The following is a run summary of the AREA test without the linear frequency dependence on the gain, with the frequency fixed (i.e. the same gain pattern
is produced for all frequencies). This run was a preliminary test of the AREA algorithm after fixing long-standing errors in the algorithm and finding
that the initial constaints implemented did not work with the frequency dependence on gain. Results from this run did show a "proof-of-concept"
Entry  Tue Mar 7 00:06:57 2023, Bryan Reynolds, Retroactive AREA update: January 18, 2022 AREA run- No linear freq. dependence test w/ increased NPop 20230201_singleFreqTest_100NPop_fitnessPlot_10Gens.PNG20230410_AREA_mostFitIndivReUpload_singleFreqTest.PNG
The following is a run summary of an AREA test using 100 individuals per generation, without the linear frequency dependence on the
gain, with the frequency fixed (i.e. the same gain pattern is produced for all frequencies). This run was a preliminary test of the AREA algorithm with
a larger NPop (100 individuals per generation) after seeing promising results in the previous test that only used 20 individuals per generation. The percentages
ELOG V3.1.5-fc6679b